Häkker Neo veedab pikki öid arvuti taga, et leida vastust küsimusele "Mis on Matrix." Ühel hetkel otsib vastus ta ise ülesse: Temaga võtab ühendust Morpheous. Morpheos annab Neole valiku võimalused: Jätkata oma vana elu ja unustada, et nad iial on kohtunud või teada saada, mis on Matrix. Neo otsusteb teise varjandi kasuks.

Järsku avastab Neo ennast täiesti uuest maailmast... Tõelisest maailmast, kus on aasta üle 2200. On olnud sõda Inimeste ja Masinate vahel. Sõja võitsid masinad ja panid inimesed neile energiat tootma. Inimestele lõid nad virtuaalse maailma, Matrixi, kus elab nende aju.

Ettekuulutuse järgi on Neo väljavalitu, kes peab inimonna sellest orjusest vabastama. Filmil on üli head võitlus stseenid ja eriefektid. Filmi stsenaarium on hoogne ja kohati raskesti jälgitav.